Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms