Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD6O43541 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms