Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP290O15078 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP290O15078 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP290O15078 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP290O15078 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP290O15078 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP290O15078 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP290O15078 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP290O15078 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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CEP290O15078 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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CEP290O15078 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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CEP290O15078 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP290O15078 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP290O15078 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP290O15078 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CEP290O15078 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CEP290O15078 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP290O15078 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CEP290O15078 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP290O15078 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP290O15078 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP290O15078 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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CEP290O15078 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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