Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF5O00463 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF5O00463 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms