Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
WASHC2CQ9Y4E1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms