Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms