Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms