Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms