Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL16

Isg20, Interferon-stimulated gene 20 kDa protein, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isg20Q9JL16 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Isg20Q9JL16 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Isg20Q9JL16 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Isg20Q9JL16 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Isg20Q9JL16 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms