Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms