Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms