Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms