Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms