Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms