Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME3Q16798 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME3Q16798 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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