Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA4Q13439 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA4Q13439 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms