Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms