Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A2P52657 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms