Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab21P35282 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab21P35282 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms