Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA4P35212 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.8 ms