Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms