Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms