Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms