Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms