Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms