Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms