Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms