Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms