Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FSCN3Q9NQT6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms