Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC6Q8IVU3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms