Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IFNL1Q8IU54 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNL1Q8IU54 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms