Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD2Q6P5Q4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms