Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms