Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 C3orf52-204ENST00000480282 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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