Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP6Q16828 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP6Q16828 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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