Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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