Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CDSNQ15517 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CDSNQ15517 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CDSNQ15517 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CDSNQ15517 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CDSNQ15517 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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