Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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