Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TROQ12816 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TROQ12816 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TROQ12816 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TROQ12816 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TROQ12816 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TROQ12816 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
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