Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK1P57059 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK1P57059 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK1P57059 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SIK1P57059 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms