Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGP37231 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGP37231 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGP37231 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPARGP37231 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPARGP37231 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPARGP37231 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPARGP37231 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPARGP37231 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPARGP37231 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPARGP37231 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPARGP37231 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms