Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA11P31270 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms