Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFP01375 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFP01375 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFP01375 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFP01375 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFP01375 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFP01375 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFP01375 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFP01375 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFP01375 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFP01375 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFP01375 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFP01375 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFP01375 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFP01375 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFP01375 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFP01375 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFP01375 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFP01375 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFP01375 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFP01375 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms