Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms