Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms