Protein–RNA interactions for Protein: O43325

LYRM1, LYR motif-containing protein 1, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM1O43325 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYRM1O43325 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYRM1O43325 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms