Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms