Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms