Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPA4Q9UI42 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms