Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms